Фамилия Духатеров — редкий пример, где основа прозвища, а не имени, соединилась с патронимическим суффиксом -ов. Если бы фамилия строилась напрямую от крестильного имени, мы бы увидели Духатов (от Духат — народная форма имени Духа, Дукьян, Евдоким), но суффикс -ер- указывает на иной путь.

Корень здесь — «дух» в значении «запах, аромат» (ср. «духовитый» — пахучий, «духан» — лавка с пряностями). Прозвище Духатерь (или Духатер) могли дать человеку, связанному с благовониями, травами или, наоборот, с резким запахом: парфюмеру, аптекарю, торговцу пряностями, а в ироничном ключе — обладателю сильного естественного «духа». Суффикс -ер- в русских прозвищах встречается редко, чаще в заимствованных словах (например, «штукатур»), но в народной речи он мог оформлять деятеля: «духатерь» — тот, кто духатит, то есть пахнет или делает пахучим.

Версия о связи с тюркским «духа» (молитва) или «духан» (постоялый двор) менее вероятна: в таком случае фамилия скорее приняла бы форму Духанов или Духаев. География фамилии узкая — единичные записи встречаются в южнорусских и казачьих областях (Ростовская область, Краснодарский край), где смешение русских и тюркских говоров давало необычные словообразовательные гибриды.

Таким образом, Духатеров — это «сын Духатеря», то есть потомок человека, чьё прозвище закрепилось за ремеслом или характерным признаком. Фамилия недвусмысленно указывает на занятие предка, связанное с запахами, и сохраняет редкую модель с суффиксом -ер-, что делает её ценной для историков языка.