Фамилия Духобор — один из самых ярких примеров русской семантической фамилии, где основа говорит сама за себя. Она образована от сложения двух корней: «дух» и «бор» (от глагола «бороть»). Прямое значение — «тот, кто борется с духом» или «победитель духа». В отличие от подавляющего большинства русских фамилий, которые восходят к крестильным именам, профессиям или прозвищам по внешности, Духобор имеет идеологическое, религиозное происхождение.

Фамилия напрямую связана с известной религиозной группой — духоборами. Это течение духовных христиан, возникшее в России в XVIII веке. Сами духоборы объясняли своё название как «борцы за дух» (против «плоти» и внешней обрядности), хотя со стороны их часто называли «борцами с Духом Святым» или, по другой версии, противниками официальной церковной иерархии. Фамилия могла закрепиться за родоначальником, который был активным проповедником или лидером этой общины. В ономастике это редкий случай, когда прозвание по вероисповеданию стало наследственным именем семьи.

Словообразовательная модель проста: основа «духобор» + типичный русский суффикс принадлежности (нулевой в именительном падеже). Фамилия не имеет суффиксов -ов/-ев или -ин, что указывает на её позднее происхождение и книжный, недиалектный характер. В крестьянской среде такие «говорящие» фамилии часто давали не по отцу, а по характеристике самого человека или его семьи. При этом стоит различать: фамилия Духобор не означает, что все её носители обязательно были духоборами по вере. В некоторых случаях она могла возникнуть как ироничное прозвище спорщика или человека, который «борется с духом» в переносном смысле — например, с пьянством или унынием.

Географически фамилия редкая. Основные очаги расселения духоборов — Тамбовская, Екатеринославская губернии, а после высылок — Закавказье (Грузия, Азербайджан) и затем Канада. Соответственно, и фамилия Духобор встречается прежде всего в этих регионах, а также среди потомков эмигрантов. В центральной России она практически не фиксируется. В отличие от фамилий типа Попов или Пономарёв, Духобор никогда не была массовой и осталась маркером узкой субкультурной группы.

С точки зрения современного носителя, фамилия звучит необычно и даже вызывающе. Она не нуждается в расшифровке через словари прозвищ — её этимология прозрачна. Но именно эта прозрачность часто вводит в заблуждение: не каждый Духобор — потомок сектанта, но почти каждый её носитель имеет предков, так или иначе связанных с этим религиозным движением, либо получил фамилию в момент, когда прозвище «духобор» было актуальным для окружающих.