Фамилия Духовский — редкий случай искусственного именования в русской ономастике. Её создали не из прозвища или профессии, а напрямую от религиозного понятия «Святой Дух» — третьей ипостаси Троицы в христианстве. По той же модели в семинарской среде появлялись фамилии Рождественский, Успенский, Богоявленский. Суффикс -ский типичен для русских фамилий, образованных от географических названий или церковных праздников, но здесь он присоединён прямо к слову «Дух» с помощью вставки -ов-.

Такие фамилии в XVIII–XIX веках часто давали воспитанникам духовных училищ и семинарий. Священнослужители могли сменить бытовую фамилию на более благозвучную и «говорящую», связанную с церковными догматами. Духовский — прямое указание на Святого Духа, которого христиане почитают как Творца невидимого и видимого миров, наравне с Отцом и Сыном. По преданию, Святой Дух нисходил на пророков, апостолов, мучеников и святых, наделяя их сверхъестественными способностями.

Важно не путать фамилию Духовский с более распространёнными Духов или Духовников. Первая образована напрямую от нарицательного «дух» с суффиксом -ов (по правилам русского языка он присоединяется к словам мужского рода, хотя есть исключения вроде Розов от «роза»). Вторая — от названия профессии «духовник». Духовский же стоит особняком: это искусственное семинарское новообразование, а не бытовое прозвище.

Географически фамилия встречается преимущественно в западных и центральных регионах России, что косвенно подтверждает её книжное происхождение — именно там находилось большинство духовных училищ. Точно определить, когда и где конкретный род Духовских получил свою фамилию, можно только по архивным метрическим книгам и клировым ведомостям — такие исследования требуют серьёзной работы с документами.