Фамилия Дурнакина — женская форма мужской фамилии Дурнакин. Она имеет ярко выраженную отрицательную окраску, но, как это часто бывает с «неблагозвучными» русскими фамилиями, её значение не стоит понимать буквально как характеристику человека.

Корень здесь — «дурн-», от прилагательного «дурной» в значении «плохой, нехороший, злой». Однако в основе фамилии лежит не прямое ругательство, а древнерусское нецерковное имя-прозвище Дурной или Дурнак. Такие имена (Некрас, Нелюб, Злоба) были распространены на Руси до XVII века и выполняли роль оберега: считалось, что имя с негативным смыслом отпугнёт злых духов и сделает ребёнка неуязвимым для сглаза. Таким образом, называя сына Дурнаком, родители желали ему обратного — удачи и здоровья.

Суффикс «-ин» указывает на принадлежность: Дурнакин — значит «сын Дурнака» или «человек из рода Дурнака». Эта модель типична для фамилий, образованных от прозвищ или имён, оканчивающихся на -а, -я. В отличие от фамилий на -ов/-ев, которые чаще встречаются в центральных и южных регионах, фамилии на -ин более характерны для северных и северо-восточных земель России.

Встречается также версия, что прозвище Дурнак могло относиться не к характеру, а к внешности или поведению — например, так могли назвать неопрятного или нерасторопного человека. Но в любом случае современный носитель фамилии может быть уверен: его предок получил прозвище не за реальные недостатки, а по народной традиции «от обратного».

Фамилия редкая, в современных справочниках массово не фиксируется, что говорит о её локальном происхождении — скорее всего, от одной крестьянской семьи в конкретной местности.