Фамилия Джанитатарин — один из тех редких случаев, когда написание почти полностью сохраняет звучание исходного слова, а корень уводит нас не в славянскую, а в тюркскую или иранскую языковую среду. Это составная фамилия, и её разбор стоит начать с конца: суффикс -ин указывает на принадлежность («чей?»). В русской модели такие фамилии образовывали от прозвищ или имён, оканчивающихся на -а/-я: Джанитатар → Джанитатарин, то есть «сын (или потомок) Джанитатара».

Основа «Джанитатар» распадается на две части. Первая — джан (от персидского и тюркского can — «душа», «жизнь», «дорогой»). Вторая — татар, что прямо указывает на этноним. В сочетании «джан-татар» могло означать «дорогой татарин», «душа-татарин» или, в переносном смысле, «татарин, который стал своим». Такие прозвища с ласкательным «джан» характерны для народов Кавказа, Крыма, Поволжья и Средней Азии — везде, где тюркские языки смешивались с персидской лексикой.

Вероятнее всего, фамилия сформировалась не в центральной России, а в среде татар-мусульман, возможно, в Крыму, Астраханской или Оренбургской губерниях, где фиксация фамилий шла позже и через русскую письменность. Носитель прозвища Джанитатар мог быть человеком, которого за душевность или близость к татарской общине прозвали «душой-татарином». Не исключён и вариант, что «джан» здесь — часть личного имени (например, Джан-Татар, где «Татар» — имя, а «Джан» — уважительная приставка).

Фамилия крайне редкая: в современных базах данных и телефонных справочниках она почти не встречается, что говорит либо о малочисленности рода, либо об угасании ветви. В отличие от массовых -ов/-ев, суффикс -ин здесь не указывает на русское происхождение основы, а лишь оформляет её по русской грамматике — типичный случай для фамилий, возникших в многонациональных регионах Российской империи. Никаких известных исторических деятелей с такой фамилией не зафиксировано, но сама конструкция — живое свидетельство языкового контакта: персидское слово, тюркский этноним и русский суффикс в одной фамилии.