Фамилия Джаукенова — яркий пример того, как русская модель образования фамилий накладывается на тюркскую основу. Суффикс «-ова» указывает на принадлежность к роду или на женскую форму фамилии. Мужской вариант — Джаукенов. Такая модель (основа + -ов/-ев) стала стандартной для многих нерусских народов Российской империи и СССР в XIX–XX веках, когда фамилии фиксировали по документам.

Основа фамилии — личное имя Джаукен. В казахском языке, откуда, скорее всего, происходит фамилия, имя Джаукен (Жәукен) — это вариант имени Жауке (Жәуке), которое, в свою очередь, могло быть образовано от арабского «джаухар» (драгоценный камень, жемчуг) с характерным для казахской фонетики изменением. Встречается и версия, что имя связано с тюркским словом «жау» (враг) и аффиксом принадлежности «-кен», но это менее вероятно: для личных имён значение «враг» нехарактерно, а вот «жемчужный» или «драгоценный» — типично.

Географически фамилия Джаукенова распространена в Казахстане и среди казахской диаспоры в России (особенно в Астраханской, Оренбургской областях). Встречается и у ногайцев, что объясняется близостью языков. В дореволюционных метрических книгах эта фамилия почти не фиксируется — она оформилась уже в советское время, когда всем гражданам стали выдавать паспорта с единообразными фамилиями. Поэтому предки носителей фамилии, скорее всего, были скотоводами или земледельцами, жившими в аулах, и их родовое имя записали по отцу — то есть по имени человека по имени Джаукен.

Сравнение с однокоренными фамилиями (Джаукенов, Жаукенов, Джауке) показывает, что вариативность написания связана с передачей казахского звука «ә» (близкого к русскому «я») через «а» или «я». Форма с «Дж» — это русская транслитерация, а «Ж» — казахская латиница или кириллица. Фамилия Джаукенова — одна из тех, что хранит в себе имя основателя рода, и её разбор даёт ключ к пониманию того, как в XX веке тюркские личные имена превращались в наследственные фамилии.