Фамилия Джоковис — редкий случай на русской почве. С первого взгляда её можно принять за южнославянскую или румынскую, но скорее всего перед нами фамилия греческого происхождения, адаптированная через посредничество других языков.

Разберём суффикс. Окончание -ис характерно для новогреческих фамилий (например, Павлидис, Иоаннидис). В греческой ономастике суффикс -idis/-adis означает «сын такого-то» или «потомок». В русской записи он часто упрощается до -ис, особенно если фамилия попала к нам через южнорусские или причерноморские территории. Таким образом, Джоковис — это «сын Джокоса» или «из рода Джокоса». Основа Джок- — это, вероятно, уменьшительная или диалектная форма от греческого имени Димитриос (Дмитрий). В греческом языке существует форма Дзёкос (Τζιόκος) или Тзиокос, которая как раз восходит к Димитриосу. Фамилии на -ис от таких основ — обычное дело для понтийских греков и греков Малой Азии, переселявшихся в Российскую империю в XIX — начале XX века.

Версия о литовском или латышском происхождении маловероятна: в балтийских языках есть фамилии на -ивис (Jokūbavičius), но окончание -овис нехарактерно, а корень Джок- не объясняется балтийской лексикой. Славянское происхождение тоже спорно: суффикс -ов- типичен для русских, украинских и болгарских фамилий (Джоков), но добавление -ис поверх него — явный признак позднейшей греческой или румынской переделки. В румынском языке фамилии на -еску (Джокеску) гораздо распространённее, чем на -ис.

Скорее всего, фамилия Джоковис возникла в среде греков, живших на территории бывшей Российской империи (Одесса, Мариуполь, Крым, Краснодарский край) или в Греции, откуда носители могли эмигрировать в Россию. Носители этой фамилии — потомки греческих переселенцев, чьи предки носили имя Димитриос в его уменьшительной форме Джокос. Фамилия не была широко распространена и осталась локальной, что объясняет её редкость в современных русских справочниках.