Фамилия Джоков — редкий случай, когда русская модель образования накладывается на нерусскую, скорее всего, тюркскую или кавказскую основу. Её структура прозрачна: суффикс -ов, типичный для русских фамилий, прикреплён к основе «Джок». Этот суффикс указывает на принадлежность («чей?») — предка могли звать Джок, и его потомки стали Джоковыми.

Самая прямая версия связывает основу с тюркским словом «джок» (или «ёк», «йок»), что значит «нет», «отсутствует». В тюркских языках (татарском, башкирском, казахском) это слово могло стать прозвищем. В ономастике известны случаи, когда прозвища давали по отсутствию чего-либо: например, человека, у которого не было чего-то важного (денег, имущества, семьи), могли в шутку или с долей иронии назвать «Джок» — «Ничего», «Пустой». Такое прозвище не обязательно было обидным, скорее бытовым и цепким. Со временем оно закрепилось как фамилия.

Другая версия отсылает к кавказскому региону. В некоторых языках народов Дагестана, Чечни или Ингушетии есть личные имена и прозвища с корнем «джок» или «жок». Например, в чеченском языке «жок» может означать «камень» или «скала», а «джок» — вариант произношения. Если так, то фамилия Джоков могла возникнуть от горского прозвища, данного крепкому, несгибаемому человеку. В пользу этой версии говорит и то, что фамилия встречается среди народов Северного Кавказа, хотя и в небольшом числе.

С точки зрения социальной истории, Джоковы — это не дворянский род. Фамилия образована по крестьянской или мещанской модели, и её носители, скорее всего, были простыми людьми: земледельцами, ремесленниками или воинами у горских народов. В документах XIX — начала XX века Джоковы встречаются в списках казачьих войск (например, Терского или Кубанского), что подтверждает кавказский след.

Однокоренных фамилий немного, но они есть: Джокаев, Джокошвили, Джокович. Последняя известна благодаря теннисисту Новаку Джоковичу, но его фамилия сербского происхождения (от уменьшительного имени Джоко, производного от Георгий). Русская фамилия Джоков с сербской не связана — это параллельное образование с разной этимологией.