Фамилия Джубатканов — тюркская по происхождению, и её разбор лучше начать с корня, а не с суффикса, потому что основа здесь куда интереснее окончания. Основа «Джубаткан» — это сложное имя или прозвище, которое распадается на две части: «джубат» и «кан». Первая часть восходит к арабскому слову «джуба» (джубба) — так называлась верхняя мужская одежда, длинный халат или кафтан, который носили в мусульманском мире. В тюркских языках, особенно в казахском и каракалпакском, это слово закрепилось как «джуба» или «жуба» — стёганый халат на вате. Вторая часть, «кан», — тюркский суффикс, который в именах часто означает «кровь», «род» или просто усиливает значение, но в данном случае он скорее указывает на обладателя: «тот, у кого есть джуба». Целиком имя Джубаткан можно перевести как «владелец халата» или «одетый в джубу».

По модели образования фамилия типична для народов Средней Азии и Казахстана: к тюркскому имени или прозвищу добавили русский патронимический суффикс -ов, который в XIX–XX веках массово приписывали при документальном оформлении. Суффикс -ан в основе (Джубаткан-ов) — не русский, а тюркский; он характерен для имён, образованных от существительных с помощью аффикса -кан (например, Айткан, Келгенкан). Фамилия Джубатканов, таким образом, означает «потомок Джубаткана», и её носители почти наверняка происходят из среды кочевых или полукочевых тюркских групп — скорее всего, казахов или каракалпаков, реже киргизов.

Интересная деталь: прозвище «владелец халата» могло быть не бытовым, а социальным маркером. В степи джуба была не просто одеждой — её носили уважаемые люди, аксакалы, либо те, кто мог позволить себе дорогую вещь из привозной ткани. Человек, которого прозвали Джубаткан, вероятно, выделялся достатком или положением: он либо торговал халатами, либо сам носил такой, что бросалось в глаза. Встречается и более прозаичная версия — прозвище могли дать портному, который шил джубы, но она менее вероятна, так как в тюркской ономастике ремесленные прозвища обычно образуются через суффикс -чи (например, Джубатчи).

Фамилия редкая, в открытых данных по России и Казахстану встречается эпизодически. Её география — южные регионы бывшего СССР: Кызылординская и Мангистауская области Казахстана, Каракалпакстан в Узбекистане. В русских документах фамилия могла записываться с вариантами — Джубатканов, Жубатканов, Джубатканулы (без русского суффикса), но форма на -ов закрепилась как стандартная при советской паспортизации. Сословного деления по этой фамилии не проследить: в степи социальное расслоение было иным, чем в России, и «владелец халата» мог быть как зажиточным скотоводом, так и простым общинником, получившим прозвище за внешний вид.