Фамилия Джушалишева — редкая, и её разговор стоит начать не с корня, а с суффикса, который сразу выдаёт географию. Окончание -ева указывает на принадлежность к женской линии (жена или дочь человека с фамилией Джушалишев). Сама же мужская форма Джушалишев образована с помощью суффикса -ев, что типично для русских фамилий, но основа явно не славянская. Такое сочетание говорит о том, что фамилия возникла в среде, где русская модель смешалась с иноязычным прозвищем или именем, — скорее всего, в районах Кавказа, Поволжья или Средней Азии, где русское делопроизводство фиксировало местные имена по своему шаблону.

Корень «Джушалиш» не имеет прямого славянского значения. Скорее всего, он восходит к тюркскому или кавказскому личному имени или прозвищу. Можно предположить, что основа «Джуша» (варианты — Джуш, Джоша) связана с тюркским словом «джуш» — «кипение», «бурление», «восторг». В переносном смысле так могли назвать горячего, вспыльчивого или, наоборот, энергичного и жизнерадостного человека. Вторая часть «-лиш» может быть суффиксом принадлежности или частью сложного имени, например, Джушали — уменьшительная форма от Джуша. Встречаются похожие фамилии у балкарцев, карачаевцев, кумыков, а также у народов Дагестана, где суффикс -ли/-лы образует прилагательные со значением «имеющий что-то» (например, Джушалы — «имеющий кипение»).

Исходное прозвище Джушалиш могло закрепиться за человеком, который выделялся характером или родом занятий — например, был кузнецом (работа с огнём и металлом ассоциировалась с «кипением») или просто обладал живым нравом. В русской среде такое имя не осмыслялось, поэтому его записали на слух, добавив типовое окончание -ев. Фамилия могла появиться в XIX — начале XX века, когда крестьян и горцев массово вносили в реестры, и часто писарь просто русифицировал то, что слышал.

Сравнение с однокоренными фамилиями (Джушаев, Джушалиев, Джушалишвили) показывает, что модель Джушалишев — самая редкая. Она встречается в единичных записях, преимущественно в южных регионах России и в Казахстане. Носительницы фамилии Джушалишева, скорее всего, потомки тех, кто в начале XX века переселился или был приписан к русскоязычным общинам. Точных данных о сословной принадлежности нет, но, судя по способу образования, предки не относились к дворянству — такие фамилии обычно давали простым крестьянам, ремесленникам или казакам, принявшим в свой состав выходцев с Кавказа.