Фамилия Джужома — редкий случай, когда основа неочевидна, а суффикс указывает на нерусское происхождение. В отличие от типичных русских фамилий на -ов/-ев или -ин, окончание -а и ударение на последний слог выдают южный колорит. Скорее всего, это украинская или белорусская фамилия, образованная по модели, характерной для западноукраинских и польских говоров: от прозвища через суффикс -ома, который встречается в фамилиях вроде Голома, Кривома, Скорома. Такой суффикс мог придавать прозвищу оттенок действия или свойства (что-то вроде «тот, кто…»).

Сама основа «джуж» — звукоподражательная. В южнорусских и украинских говорах «джужжати» означает жужжать, гудеть. Прозвище Джужома могли дать человеку с громким голосом, болтливому или, наоборот, тому, кто постоянно ворчал себе под нос, как шмель. В польском языке есть слово «dżdżdż» (дождь), но для фамилии это менее вероятно: переход от «дождя» к прозвищу сложнее, чем от звука.

Географически фамилия привязана к западным регионам бывшей Речи Посполитой: Волынь, Подолье, Галиция. Встречается в современных записях на западе Украины и в Беларуси, единичные носители есть в России, но это, как правило, потомки переселенцев XIX — начала XX века. Сословно — почти наверняка крестьянская или мещанская: такие звукоподражательные прозвища редко давали дворянам, у которых преобладали фамилии от географических названий или имен.

Есть и альтернативная версия: основа могла быть заимствована из тюркских языков (сравните «джужук» — маленький, в некоторых диалектах), но она слабая, так как суффикс -ома не характерен для тюркских фамилий, а звуковой облик скорее славянский. Поэтому самая правдоподобная гипотеза: прозвище Джужома — «жужжащий» человек, говорун или ворчун, а фамилия закрепилась на западноукраинских землях.