Фамилия Ебигусей — одна из тех, что заставляет задуматься в первую очередь о необычном звучании, а не о происхождении. На первый взгляд она кажется искусственной или заимствованной, но на деле её корни лежат в живой народной речи, а точнее — в прозвищах, которые давали людям на Руси.

Ключ к разгадке — основа «Ебигус». Скорее всего, это искажённое или диалектное произношение глагольной формы «еби гусей». Перед нами не фамилия, образованная от имени или профессии, а застывшее в виде прозвища повелительное наклонение. Такие «глагольные» фамилии (вроде Убейсобака, Дайбог, Пейвода) редкость, но они встречаются, особенно в среде крестьянства и казачества. В данном случае прозвище мог получить человек, который пас гусей, торговал ими или, что вероятнее, отличался грубым, приказным нравом. Фамилия буквально означает «тот, кто гоняет гусей».

Суффикс «-ей» в окончании — это адаптация под русскую модель склонения. В русском языке фамилии на «-ей» (как Ебигусей, Коробей, Злодей) часто возникали из прозвищ, оканчивающихся на согласный, чтобы их можно было склонять как существительные мужского рода. То есть исходное прозвище звучало как «Ебигус», а потом, для удобства, к нему добавили «-ей», либо оно само трансформировалось в произношении.

Версия о происхождении от тюркского или кавказского имени маловероятна. Ни в одном известном ономастиконе (ни у Унбегауна, ни у Никонова) нет корня, который бы давал такое звучание. Семантика «гусь» в тюркских языках (каз) или «есть/кушать» (е-) не складывается в осмысленное имя. Поэтому народно-диалектная версия с глаголом остаётся единственной правдоподобной.

Географически фамилия крайне редкая. Если она и встречается, то, вероятно, в южнорусских или украинских областях, где гусеводство было распространено, а диалекты сохраняли грубоватые глагольные формы. Носители фамилии, если они есть, — потомки тех, кого в XIX веке записали по прозвищу, которое могло быть и нелестным, и шутливым, и просто описательным. Никаких дворянских родов или известных исторических личностей с такой фамилией не зафиксировано.