Фамилия Эбиналь — редкая, и её происхождение неочевидно. Если отбросить маловероятные экзотические версии, остаётся одна, наиболее логичная: она имеет тюркские корни и восходит к прозвищу или имени Эбиналь.

В основе лежит тюркское слово «эби» (или «эбе») — «бабушка», «старуха», а в переносном смысле — «почтенная женщина», «прародительница». Вторая часть «-наль» может быть вариантом тюркского «ал» (брать, владеть) или аффиксом принадлежности. Таким образом, Эбиналь — это «принадлежащий бабушке», «бабушкин», то есть человек, которого воспитывала бабушка, либо потомок уважаемой женщины. В тюркской среде такие прозвища давали сиротам или младшим детям, оставшимся на попечении старшего поколения.

Суффикс фамилии —ев (в исходной форме Эбинальев) указывает на русскую модель образования от тюркского имени. Такие фамилии массово возникали в XVI–XIX веках у татар, башкир, азербайджанцев и других народов, входивших в состав Российской империи. Фамилия Эбиналь, скорее всего, прошла через усечение окончания —ев, что иногда случалось при русификации или записи в документах.

Географически фамилия тяготеет к Поволжью и Предуралью — регионам, где тюркские имена смешивались с русской фамильной системой. Встречается она крайне редко, что говорит о локальном происхождении: возможно, от одного родоначальника в конкретном селе или ауле.

Иной версии, связывающей фамилию с европейскими или кавказскими корнями, нет — ни в одном известном словаре (Унбегаун, Никонов, Веселовский) фамилия не фиксируется, что подтверждает её позднее и узколокальное бытование.