Фамилия Ехрина — женская форма, а её мужской вариант — Ехрин. В основе лежит, скорее всего, не церковное имя, а мирское прозвище или производное от крестильного имени. Самый прямой путь — от просторечной формы имени Ефрем. В народе это имя нередко звучало как Ехрем, а уменьшительно-ласкательно — Ехря или Ехра. Отсюда и пошло: Ехра + суффикс принадлежности -ин, то есть «сын Ехры». Фамилия образована по типичной восточнославянской модели: сначала прозвище или домашнее имя, потом отчество на -ин, которое и закрепилось как фамильное прозвание.

Суффикс -ин указывает на принадлежность к конкретному человеку (чей? — Ехрин). Такие фамилии чаще всего встречались на севере и в центральной России, где активно использовали эту модель. Если бы основа оканчивалась на согласный, стоял бы суффикс -ов, но здесь финаль на -а, поэтому закономерно -ин.

Вторая, менее вероятная версия, — связь с диалектным словом. В некоторых говорах «ехра» или «ехря» могло означать неуклюжего, нерасторопного человека. Такие прозвища по характеру или внешности давали часто, и они тоже становились фамилиями. Однако первая гипотеза (от имени Ефрем) выглядит убедительнее, потому что уменьшительные формы от церковных имён — самый массовый источник русских фамилий.

Фамилия редкая, в старых писцовых книгах и переписях почти не всплывает. Это говорит о том, что род мог быть немногочисленным или жить в глухой местности, где фамилии закрепились позже, уже в XIX веке. Встречаемость Ехриных сегодня — единичные случаи, в основном в центральных регионах России.