Фамилия Екмалян — типичная армянская родовая фамилия, указывающая на происхождение от конкретного места. Она образована по распространённой модели с суффиксом -ян, который в армянском языке (как и его более ранняя форма -янц) означает принадлежность к роду или клану. Буквально фамилия отвечает на вопрос «из семьи кого?» или «из какого рода?». В данном случае — из рода, связанного с топонимом Екмал.

Основа фамилии — название села Екмал. Вероятнее всего, основатель рода Екмалян был уроженцем этого села, и его потомки получили прозвание по месту выхода. Сам топоним Екмал, по одной из версий, восходит к санскриту и переводится как «единственное поле». Это редкий случай, когда армянский географический объект прослеживается до столь древнего индоевропейского корня, что добавляет фамилии глубину.

Словообразовательная цепочка проста: название села Екмал → суффикс принадлежности -ян → фамилия Екмалян, которая первоначально значила «из рода Екмала» или «выходец из Екмала». В армянской ономастике такой способ (от топонима с суффиксом -ян) — один из самых продуктивных, наряду с фамилиями от личных имён, прозвищ или профессий.

Среди известных носителей — Макар Григорьевич Екмалян (1856–1905), армянский композитор. Его творчество, в частности хоровые сочинения и обработки народных песен, хорошо известно в армянской музыкальной культуре. Других широко известных однофамильцев нет, что делает фамилию относительно редкой, но с чёткой географической и этимологической привязкой.