Фамилия Екусова — женская форма фамилии Екусов, и её разбор стоит начать не с корня, а с географии. Это редкая фамилия, которая почти не встречается за пределами определённых регионов. Основной ареал — Урал и Западная Сибирь, особенно Пермский край и Свердловская область. Такая локализация наводит на мысль, что фамилия сформировалась в среде коми-пермяков или в русских говорах, испытавших финно-угорское влияние.

Модель образования проста: суффикс -ов/-ев, самый распространённый в русских фамилиях, прикреплён к основе Екус. Эта основа — прозвище или неканоническое имя Екус. В русских диалектах слово «екусить» или «екать» могло означать «заикаться», «говорить с запинкой», «тянуть слова». Человек с такой речевой особенностью легко получал прозвище Екус — так же, как заику могли назвать Заикой, а шепелявого — Шепелем. Прозвище было описательным, без намёка на осуждение, просто фиксировало характерную черту.

Есть и другая версия, менее вероятная, но допустимая: Екус — это вариант имени Якус, народной формы от Яков. В некоторых говорах начальное «я» переходило в «е», и Якус превращался в Екуса. Однако против этого говорит то, что форма Якус и сама по себе редка, а её «екающий» вариант почти не засвидетельствован в письменных источниках. Первая версия — с прозвищем от диалектного глагола — выглядит убедительнее, тем более что в уральских говорах действительно бытовало слово «екусить» в значении «мямлить, говорить невнятно».

Фамилия Екусов (и Екусова) не принадлежала дворянству или купечеству — это крестьянская фамилия, возникшая в среде черносошных или государственных крестьян. В документах XVIII—XIX веков её носители фиксируются в основном в Пермской губернии, в Оханском и Осинском уездах. Там же встречаются однокоренные фамилии — Екушев, Екушин, что подтверждает местный характер прозвища. Суффикс -ов указывает на принадлежность: Екусов буквально означал «сын Екуса», то есть потомок человека с таким прозвищем.

Если сравнивать с другими фамилиями, образованными от речевых особенностей — Заикин, Шепелев, Картавов, — то Екусова стоит в том же ряду, но с редкой диалектной основой. Это не делает её «интереснее» других, но объясняет, почему носители фамилии до сих пор сконцентрированы на небольшой территории: прозвище не стало общеупотребительным, а осталось местным словом.