Фамилия Эмбаухов — редкий случай в русском ономастиконе. Её основа и суффикс указывают на нерусское, скорее всего, тюркское или кавказское происхождение. Скорее всего, перед нами фамилия, образованная от имени или прозвища Эмбаух. Суффикс -ов здесь типичен для русской модели адаптации иноязычных фамилий: он указывает на принадлежность («чей?» — Эмбаухов, то есть сын или потомок Эмбауха).

Сама основа Эмбаух — сложная. Первая часть «Эмб-» может восходить к тюркскому «эм» — «лекарство», «целительство», или к кабардино-черкесскому имени «Эмба» (вариант имени Хамзат). Вторая часть «-аух» — вероятно, диалектное или локальное окончание, характерное для фамилий народов Северного Кавказа (ср. Аухов, Баркаухов). В таком случае фамилия могла означать «потомок лекаря» или «сын человека по имени Эмба».

Географически фамилия Эмбаухов привязана к Северному Кавказу, в первую очередь к Кабардино-Балкарии и Карачаево-Черкесии. Встречается она и среди казаков-некрасовцев, переселившихся с Кубани в Турцию, а затем вернувшихся в Россию. Среди носителей фамилии есть представители адыгских и тюркских народов. В русских документах XVIII–XIX веков фамилия могла записываться через «а» — Эмбаухав или Амбаухов, что связано с особенностями передачи гортанных звуков на письме.

Таким образом, Эмбаухов — не случайная фамилия. Она несёт в себе след межэтнических контактов: тюркское или кавказское личное имя, «обрусевшее» через суффикс -ов. По социальному происхождению предки Эмбауховых были, скорее всего, горцами или казаками, а не дворянами — фамилия не попала в родословные книги Российской империи и осталась локальной.