Фамилия Эмирагаев — яркий пример того, как тюркские и арабские элементы сплавились в русской фамильной модели. Её основа — составное имя Эмирага, которое в свою очередь складывается из двух частей: «эмир» (араб. «повелитель», «князь») и «ага» (тюрк. «господин», «старший», «хозяин»). Получается двойное обозначение высокого статуса — «господин-повелитель» или «князь-господин». Такие составные имена были популярны у народов Кавказа и Поволжья, особенно у азербайджанцев, кумыков и лезгин.

Русский суффикс -ев присоединился к основе, когда фамилию фиксировали в документах. По модели «Эмирага + ев» она означает «сын Эмираги» или «принадлежащий Эмираге». Это типичный для русской традиции способ оформления тюркских имён: как у Абдуллаев, Ахмедов, Магомедов. Форма с -ев, а не -ов, объясняется тем, что основа заканчивается на мягкий согласный или гласный (в имени Эмирага конечный «а» мягчит предшествующий «г»).

Географически фамилия тяготеет к Дагестану, особенно к кумыкским и лезгинским районам. Встречается она и среди азербайджанцев. Предок-носитель такого имени, скорее всего, был уважаемым человеком в своей общине — не обязательно князем, но, возможно, зажиточным хозяином, старшиной или духовным лицом. Прозвище «эмирага» могли дать и в насмешку, если человек вёл себя «по-барски», но это менее вероятно: обычно такие имена давали с серьёзным расчётом на будущий статус ребёнка.

Ударение в фамилии плавающее: в быту чаще говорят Эмира́гаев (с ударением на второй слог), но в официальных документах встречается и Эмирага́ев. Это не ошибка, а отражение разного ритма в тюркском и русском произношении. В целом фамилия редкая, за пределами Кавказа почти не встречается, что делает её точным маркером происхождения из этого региона.