Фамилия Емохонова — редкий случай, когда географическая привязка оказывается надёжнее, чем прозрачная этимология. Сразу скажем главное: носительницы этой фамилии почти наверняка родом из среды русских старообрядцев, живших в Забайкалье или на Алтае. В словарях русских фамилий она не зафиксирована, но в региональных списках «семейских» (старообрядцев Забайкалья) встречается вариант Емохонов.

Основа фамилии — Емохон. Это древнее русское нецерковное имя или прозвище, которое могло возникнуть из двух источников. Первый — от слова «емоха» (просторечная, диалектная форма глагола «есть», «кушать»). В таком случае прозвище Емохон давали человеку с хорошим аппетитом, любителю поесть. Второй, более правдоподобный вариант — связь с тюркскими языками. В бурятском и монгольском есть слово «эмээл» (седло), а «емохон» могло быть искажением тюркского имени Емеген или Емекен. Учитывая, что фамилия бытовала в зоне активных контактов русских с бурятами и монголами, прозвище могло означать «седельщик», «мастер по сёдлам» или просто «всадник».

Суффикс -ов- указывает на стандартную русскую патронимическую модель: Емохонов — сын Емохона. Ударение в фамилии, судя по произносительной норме в Забайкалье, падает на третий слог: Емохо́нова. Форма на -а характерна для женского варианта, мужской — Емохонов.

Интересна и социальная подоплёка. Фамилия не встречается в дворянских родословных книгах и не фиксируется в центральных губерниях России. Её носители — потомки крестьян-старообрядцев, которых в XVIII веке насильственно переселяли в Забайкалье. Они сохраняли архаичные говоры и имена, поэтому «Емохон» могло быть не прозвищем, а дохристианским именем, которое в центральной России уже вышло из употребления. Если ваши предки носили эту фамилию, стоит искать корни в Читинской области, Бурятии или на Алтае — там фамилия сохранилась до сих пор.