Фамилия Емсин представляет собой фонетический вариант фамилии Емшин, которая имеет топонимическое происхождение. Вероятно, она образована от прозвища Емшин, которое происходить от названия деревни и реки Емша Осташковского района Тверской области. Река Емша упоминается в Грамоте царей Иоанна и Петра Алексеевичей 1697 года в ряду гидронимов Емша, Мшена, Горелая Мшарка. По ряду данных на возвышенной гряде реки возникло селение, получившее название Емша. Оно лежало на важных сухопутных путях ржевско – сторопецкого и старорусского трактов и была почтовой станцией. Река, на которой до середины XVIII века стояла мельница, принадлежавшая еще Борису Михайловичу Лыкову, а затем Пафнутие – Боровскому монастырю, названа по селению. Вполне вероятно, что фамилия Емсин происходит от имени Емса. Оно представляет собой производную форму имени Еремей, которое в переводе с древнееврейского означает «возвышенный Богом». В результате, потомок человека, обладающего прозвищем Емшин, со временем получил фамилию Емсин.