Фамилия Емвужева — редкая и нестандартная для русского слуха. Её происхождение почти наверняка не славянское, а адыгское (черкесское). Основа фамилии — мужское имя Емвужа (или Емвуж), которое, в свою очередь, распадается на две части: «ем» (вариант «ям») и «вуж» (или «бжьэ»). В адыгских языках «ям» означает «овца», а «бжьэ» — «рог». Таким образом, имя Емвужа могло быть прозвищем человека, связанного с овцеводством, или указывать на черту характера — упрямство, «рогатость» в переносном смысле.

Суффикс «-ева» указывает на принадлежность: Емвужева — дочь или жена человека по имени Емвужа. Это типичная модель образования фамилий у адыгов (черкесов, кабардинцев, адыгейцев), когда к родовому имени добавляется русский патронимический суффикс. Фамилия могла закрепиться в XIX веке, после Кавказской войны, когда горцев начали массово записывать в метрики и ревизские сказки, русифицируя окончания.

Географически фамилия тяготеет к Кабардино-Балкарии, Карачаево-Черкесии или Адыгее. Встречается она крайне редко — носителей, скорее всего, не больше нескольких десятков семей. Это не фамилия знатного княжеского рода, а скорее крестьянская или узденьская (свободного общинника), образованная от личного прозвища. В русском языке у фамилии нет однокоренных вариантов, что подтверждает её изолированное кавказское происхождение.

Если искать параллели, можно вспомнить фамилию Емкужев (с тем же корнем «ем» и суффиксом «-куж» — «сын»). Но Емвужева — самостоятельная форма, где вторая часть «вуж» звучит архаично. В современном адыгском языке слово «бжьэ» (рог) произносится иначе, поэтому фамилия сохранила старое диалектное звучание.