Фамилия Енатьева — женская форма, а её мужской вариант — Енатьев. Это относительно редкая русская фамилия, и её разбор упирается в неочевидную основу. Главная трудность в том, что слово «енать» не встречается ни в древнерусских словарях, ни в современных говорах как самостоятельное нарицательное имя. Поэтому этимологию приходится строить через гипотезы, и самая правдоподобная из них — связь с диалектным или искажённым личным именем.

Скорее всего, в основе лежит каноническое имя Ионат (или Ионафан), которое в народном произношении могло звучать как «Енат». Имя Ионат из греческого «иоанн» (Бог дал) или древнееврейского «Ионатан» (дар Божий) в русской среде упрощалось: падение начального «и» и замена «ф» на «т» давали форму Енат. От неё через притяжательный суффикс -ев и возникла фамилия Енатьев: буквально «сын Ената». Суффикс -ев указывает на происхождение от имени на мягкий согласный или -а/-я, что как раз подходит.

Менее вероятная, но допустимая версия — связь с глаголом «ять» (брать, владеть) с приставкой «на»: «наять» — набрать, захватить. В этом случае прозвище Наят могло дать человеку, который «набирает» добро или людей, а потом через перестановку звуков (метатезу) превратиться в Енат. Однако такая версия слабее, потому что метатеза в фамилиях — явление редкое, а имя Енат фиксируется в исторических документах. Например, в XVI–XVII веках в переписных книгах встречаются крестьяне Енатка и Енатовы, что подтверждает бытование основы как личного имени.

Географически фамилия Енатьевы тяготеет к северным и центральным областям России: Вологодчина, Архангельская губерния, а также Поволжье. В XIX веке носители фамилии — в основном государственные крестьяне и мещане. Дворянских родов с такой фамилией не зафиксировано, что говорит о её простонародном происхождении: предки Енатьевых, скорее всего, были крестьянами или посадскими людьми, носившими уличное прозвище по имени отца.

С точки зрения словообразования фамилия стандартна: основа Енат- + суффикс -ев- + окончание -а. Интересная деталь — сохранение мягкого знака в суффиксе перед -ев, что типично для фамилий от имён на -ать, -ять (например, Игнатьев, Астафьев). Это указывает на то, что исходное имя действительно заканчивалось на -ать, а не на -ат. Таким образом, Енатьев — не искажение, а регулярная форма от имени Енатий (производное от Ионат), что подтверждается аналогиями в русской ономастике.