Фамилия Эндгеева — редкий случай в русском ономастиконе, и её происхождение не лежит на поверхности. Первое, что бросается в глаза, — нехарактерное для славянских фамилий сочетание «ндг». Это сразу указывает на иноязычную основу, скорее всего, тюркскую или кавказскую. Сама фамилия, вероятно, образована по русской модели с помощью суффикса -ев, который присоединили к основе Эндге.

Корень «Эндге» можно связать с тюркскими языками, где «энд» или «енд» часто означает «широкий» или «просторный», а в некоторых диалектах — «сторона» или «край». Вторая часть — «ге» — могла быть уменьшительным или ласкательным аффиксом. Таким образом, прозвище Эндге могло обозначать человека «широкого», «просторного» — возможно, крупного телосложением, либо того, кто жил на отшибе, на краю селения. В тюркской среде прозвища нередко давали по внешним признакам или месту жительства.

Другая, не менее правдоподобная версия ведёт к калмыцкому или монгольскому языку. В калмыцком есть слово «эндг» — «здесь», «тут». Прозвище Эндге могло закрепиться за пришлым человеком, которого называли «здешним» в насмешку или для отличия от кочевников, — или за ребёнком, родившимся на новом месте. Суффикс -ев в таком случае — чисто русское оформление фамилии при переходе в православие или при записи в документы.

Географически фамилия Эндгеева встречается в основном в южных регионах России, особенно в Калмыкии и Астраханской области, что подтверждает её калмыцкие корни. Встречаются также единичные случаи в Дагестане и Ставрополье. Сословно носители фамилии чаще всего были крестьянами или казаками, но точных данных о принадлежности к дворянству нет — фамилия слишком редкая и локальная.

Словообразовательная модель проста: основа Эндге + патронимический суффикс -ев, указывающий на принадлежность («чей?» — Эндгеев). Женская форма Эндгеева образована по тому же правилу. Ударение, скорее всего, падает на первый слог: Э́ндгеева, хотя в устной речи возможны варианты.

Если искать аналоги, то фамилия стоит в одном ряду с калмыцкими фамилиями вроде Манджиева, Бамбаева — все они образованы от личных имён или прозвищ с помощью русского суффикса. Спорных версий немного: связывать Эндге с немецким Endge (конечный) или финским эпосом — натяжка, так как ни география, ни язык не дают для этого оснований. Надёжнее всего — тюрко-калмыцкий след.