Фамилия Эндзин — редкая и неочевидная для русского уха. Её происхождение почти наверняка не связано с исконно русскими корнями, и это первый ключ к разгадке. В русском языке нет морфемы «эндз-», а финальное -ин указывает на две возможные модели: либо это русифицированная форма иноязычной фамилии, либо — притяжательный суффикс, но тогда основа должна быть понятна носителю языка.

Самый вероятный путь — фамилия имеет тюркское или бурятско-монгольское происхождение. В этих языках слово «эндзи» (или «энзэ») может означать «драгоценность», «жемчужина» или «сокровище». В таком случае фамилия Эндзин — это русская запись исходного имени или прозвища, означавшего «драгоценный», «ценный». Суффикс -ин здесь выполняет роль адаптации: «чей?» — «Эндзин», то есть «потомок того, кого звали Эндзи». Подобная модель характерна для фамилий, возникших на восточных окраинах Российской империи, особенно в Забайкалье, Бурятии и среди поволжских татар.

Менее распространённая, но возможная гипотеза — связь с японским языком, где есть фамилия Эндзё (円城) или имя Эндзин (円陣), но в русской транскрипции они обычно передаются иначе, и массового проникновения таких фамилий в русскую среду не было. Поэтому тюркско-монгольская версия предпочтительнее — она объясняет и географию, и словообразовательную модель.

Таким образом, предки носителя фамилии Эндзин, скорее всего, жили в Сибири или на Урале, в среде, где смешивались русские и тюрко-монгольские народы. Сама фамилия — не ремесленная и не сословная, а прозвищная: она указывает на личное качество или пожелание, заложенное в имени родоначальника.