Фамилия Енидорцева — редкая, и её разбор требует осторожности, потому что очевидного корня в современном русском языке нет. Скорее всего, перед нами вариант фамилии, образованной от прозвища, которое в свою очередь возникло из диалектного или искажённого слова.

Наиболее правдоподобная версия связывает основу «Енидор-» с южнорусскими говорами. В курских и орловских диалектах существовало слово «енидор» или «яндырь» — так называли человека с неспокойным, вздорным характером, «ершистого», неуживчивого. Если это так, то прозвище Енидорец (или Енидор) давали сварливому, придирчивому человеку. Фамилия образовалась по стандартной модели: прозвище на -ец → фамилия Енидорцев → женская форма Енидорцева. Суффикс -ев- указывает на принадлежность («чей?» — сын Енидорца), а окончание -а — на женский род носительницы.

Менее вероятна, но возможна связь с тюркскими корнями. В татарском и башкирском языках есть имя Яндур (Яндурза), которое могло адаптироваться в русской среде как «Енидор». В этом случае фамилия могла бы указывать на происхождение от крещёного татарина или башкира. Однако фонетически «Енидорцева» дальше от тюркских прототипов, чем от русских диалектизмов, поэтому первая версия выглядит предпочтительнее.

Географически фамилия тяготеет к Центральной России и Поволжью, особенно к бывшим территориям Курской, Тамбовской и Саратовской губерний. Там же встречаются однокоренные фамилии — Енидорцев, Янидорцев, Ендовицкий, что подтверждает диалектную природу основы. Социальный контекст простой: носители фамилии, скорее всего, были крестьянами или однодворцами, а прозвище закрепилось за родом из-за яркой черты характера первого носителя.

Словообразовательная модель здесь нестандартная: фамилия содержит редкий для русских фамилий суффикс -ец- в основе, что делает её похожей на отчества от прозвищ с уменьшительным или характеризующим оттенком (ср. Молодец → Молодцев, Удалец → Удальцев). Таким образом, Енидорцева буквально значит «дочь или жена потомка того самого Енидорца».