Фамилия Енова — женская форма фамилии Енов. Чтобы понять её происхождение, нужно разобрать мужской вариант. Основа фамилии — имя или прозвище Ен. Самая очевидная версия: Ен — это краткая форма от крестильного имени Еней. Имя Еней — русская народная переделка канонического имени Эней, которое попало в православные святцы из античной мифологии (герой Троянской войны). В крестьянской среде сложные греческие и латинские имена нередко урезали до одного-двух слогов, отсюда и появился Ен.

Суффикс -ов указывает на типичную русскую патронимическую модель: Енов — сын Ена. Фамилия могла возникнуть в XVI–XVII веках, когда такие «полуотчества» на -ов закреплялись за целыми родами. Географически фамилия Енова встречается в основном в центральных и северных областях России, особенно в Вологодской и Архангельской губерниях, где имя Еней фиксировалось в переписных книгах.

Есть и другая, менее вероятная версия: прозвище Ен могло произойти от диалектного слова «ень» — так в некоторых говорах называли омут или глубокое место в реке. Человек, живший у такого омута, мог получить прозвище Ен, а его потомки — фамилию Еновы. Но эта версия спорная, так как слово «ень» редкое и локальное, а имя Еней в старых документах встречается чаще.

Фамилия Енова не принадлежала дворянству — это типичная крестьянская или посадская фамилия. Носительницы этой фамилии, скорее всего, потомки простых людей, чей предок носил имя Ен или жил у речного омута. Других версий, например, связи с тюркскими или финно-угорскими корнями, у этой фамилии нет — она чисто славянская по модели образования.