Фамилия Енушкова — женская форма фамилии Енушков, которая образована по самой распространённой в русской ономастике модели: от прозвища или имени с помощью патронимического суффикса -ов. В основе лежит имя или прозвище Енушко. Это уменьшительно-ласкательная форма от крестильного имени Енох (библейский Енох, праведник, взятый живым на небо). Имя Енох в русской традиции встречалось редко, чаще — в среде старообрядцев, где библейские имена были в ходу. Суффикс -ушк- (в форме Енушко) характерен для севернорусских и западнорусских говоров: так образовывали обиходные варианты имён (ср. Иван — Иванушко, Пётр — Петрушко).

Вероятно, предок носителя фамилии был из крестьян или посадских людей, так как фамилии на -ов в XVI–XVII веках закреплялись в первую очередь у служилых и тяглых сословий. Фамилия редкая, её география тяготеет к регионам, где сохранялись старые формы имён: Псковская, Новгородская, Вологодская области. Встречается также в записях переписей по Пермской губернии — туда переселялись староверы, и имя Енох могло бытоваться в их среде.

С точки зрения словообразования, фамилия Енушков стоит в одном ряду с однокоренными Енухов, Енухин, Енушев, но отличается именно уменьшительным суффиксом, что указывает на прозвищное, бытовое происхождение: Енушком могли звать ребёнка или младшего в семье. Это не дворянская фамилия — в родословных книгах она не значится, её носители — люди из народа, чью историю можно проследить по писцовым книгам и метрикам.