Фамилия Епечурин — редкая и неочевидная. В ней нет привычных русских суффиксов -ов или -ин, и это сразу указывает на нерусское происхождение. Скорее всего, перед нами фамилия, образованная от тюркского имени или прозвища, и её стоит разбирать не по славянским, а по восточным моделям словообразования.

Основа фамилии — «Епечур». Это имя или прозвище, которое могло сложиться из двух частей. Первая часть «Епе-» — вариант тюркского «Эпе», что в ряде тюркских языков (например, в казахском или башкирском) означает «старшая сестра», «почтенная женщина» или «бабушка». Вторая часть «-чур» — распространённый тюркский аффикс, образующий названия деятеля или обладателя признака. Таким образом, «Епечур» можно перевести как «тот, кто связан со старшей женщиной» или «почтенный». В русскую речь имя попало через фонетическую адаптацию: тюркское «Эпечур» стало звучать как «Епечур».

Фамилию Епечурин зафиксировали в русской среде по модели, характерной для регионов Поволжья и Урала, где веками жили татары, башкиры и чуваши. Окончание -ин, а не -ов, говорит о том, что фамилия могла быть образована от имени отца по принципу «чей?»: «сын Епечура» — Епечурин. Это типично для русских фамилий тюркского происхождения, которые нередко получали суффикс -ин, а не -ов.

Географически фамилия тяготеет к Оренбургской области и Башкортостану. В этих местах фамилии на -ин от тюркских основ встречаются часто. Предки носителей фамилии, вероятно, были крещёными татарами или башкирами, либо русскими, взявшими в обиход тюркское прозвище. Род занятий установить трудно, но прозвище «Епечур» не указывает на ремесло или сословие — скорее, на личную черту или семейное положение: уважаемый человек, старейшина, возможно, опекун в роду.

Встречаются однокоренные фамилии: Епечуров, Епечуркин, но Епечурин — самая распространённая форма. В отличие от них, она сохранила исходный суффикс -ин, что может говорить о более раннем и прямом заимствовании имени без дополнительных переделок.