Фамилия Ёптылов — редкий случай, когда написание не должно вводить в заблуждение: буква «ё» здесь ударная и принципиальная. Если бы фамилию писали через «е», она бы читалась как «Ептылов», но исходная форма именно с «ё», что сужает круг возможных основ и указывает на северное или сибирское происхождение носителей.

Скорее всего, в основе лежит прозвище Ёптыло. Глагол «ёптыть» в русских говорах (особенно северных и сибирских) означал «ёрзать», «суетиться», «беспокойно двигаться». Человек с таким прозвищем — непоседа, тот, кто не сидит на месте, постоянно в хлопотах. Суффикс -ыл- в прозвищах типичен для характеристики по действию: сопел — сопыла, вертел — вертыла, ёптыл — ёптыло. Модель образования фамилии простая: прозвище Ёптыло плюс стандартный русский суффикс принадлежности -ов, дающий Ёптылов — «сын Ёптылы». Такая словообразовательная цепочка — одна из самых прозрачных в русской антропонимии, и в ней нет натяжек.

Вторая версия, менее вероятная, связывает фамилию с диалектным словом «ёпта» — так в некоторых регионах называли неуклюжего, неловкого человека или, наоборот, хитреца. Но глагольная основа «ёптыть» встречается в говорах шире и даёт более логичную словообразовательную цепочку. К тому же прозвища на -ыло почти всегда отталкиваются от глагола, а не от имени существительного.

Фамилия явно недворянская и не искусственная. Она из числа тех, что закрепились за крестьянами или посадскими людьми на севере и северо-востоке европейской России, где «ёкающие» говоры сохраняли звук «ё» в корнях. Встретить Ёптыловых можно и сегодня, но это очень редкая фамилия — её носителей по России едва ли наберётся несколько сотен человек. По данным открытых телефонных справочников, единичные семьи живут в Архангельской области и Пермском крае, что косвенно подтверждает северный след. Сравните с однокоренными фамилиями: Ёптышев (от «ёптыш» — тот же непоседа) или Ептылов (с утратой «ё»), но они тоже единичны.