Фамилия Ергомышева — редкий случай, когда основа слова не поддаётся однозначной расшифровке и заставляет задуматься о диалектных корнях. Принадлежит к распространённому типу русских фамилий на -ов/-ев, образованных от мужского прозвища или имени. В основе лежит слово «ергомышь» (или «ергомыш»), которое сегодня почти не встречается в литературном языке.

Самая вероятная версия связывает «ергомышь» с диалектным глаголом «ергаться» — ёрзать, беспокойно двигаться, суетиться. В северных и сибирских говорах «ерга» означала непоседу, а «ергомышь» могло быть прозвищем для суетливого, неусидчивого человека, который всё время «мышкует» (мелко, по-мышиному хлопочет). Модель образования напоминает слова вроде «вертомышь» — тоже прозвище для вертлявого человека. Суффикс -ыш- здесь указывает на носителя признака, часто с оттенком пренебрежения или шутки.

Менее убедительна, но допустима версия о связи с тюркскими языками. В некоторых тюркских наречиях «ер» — земля, а «гомыш» (или «комыш») — камыш. Тогда «ергомыш» могло означать «земляной камыш» или быть топонимическим прозвищем человека, жившего у камышовых зарослей. Однако фонетика фамилии и её чисто русский суффикс -ев делают эту гипотезу слабой: для тюркского заимствования форма скорее была бы Ергомышев (с тем же окончанием), но объяснение через «ергаться» выглядит естественнее.

Фамилия встречается крайне редко, в основном на Урале и в Западной Сибири — в регионах, где сохранились древние говоры. Известных носителей в открытых источниках нет, что только подчёркивает её локальный, возможно, крестьянский или казачий характер. Сословная принадлежность предков — скорее всего, государственные крестьяне или однодворцы, поскольку фамилия не попала в дворянские родословные книги.

Интересная деталь: ударение в фамилии плавающее. В большинстве говоров его ставят на второй слог — Ерго́мышева, но в некоторых семьях сохраняется ударение на последний слог (Ергомышева́), что может указывать на первоначальную форму прозвища с ударным окончанием.