Фамилия Ерцкина — женская форма фамилии Ерцкин. Её основа, скорее всего, восходит к топониму, а не к личному имени или профессии. В русской ономастике фамилии с суффиксом -ин обычно образовывались от названий, оканчивающихся на -а или -я, но здесь мы видим редкий случай: корень Ерц- плюс суффикс -к- и затем -ин. Такая модель указывает на происхождение от географического названия с суффиксом -цк- (типа Ерцк, Ерцкое). В русской традиции фамилии на -цкий/-цкая (и их усечённые варианты) часто давались выходцам из определённой местности.

Наиболее вероятная версия — связь с названием населённого пункта Ерц или Ерцы. Такие топонимы встречаются в северных и центральных областях России, например, в бывшей Вологодской губернии. В этом случае предок носителя фамилии был выходцем из деревни Ерцы или села Ерцкое. Суффикс -к- мог появиться в результате народного переосмысления: вместо «ерцкий» стали говорить «ерцкин», что характерно для живой речи, где фамилии на -ский иногда «укорачивали» до более простых форм.

Менее вероятная, но возможная версия — прозвищное происхождение. В некоторых говорах «ерц» могло означать нечто мелкое, колкое или суетливое (сравните с диалектным «ерзать»). Однако для прозвищ обычно использовали суффикс -к- без топонимического оттенка (Ерка, Еркин), а форма Ерцкин с мягким «ц» скорее указывает на книжное, «польское» или западнорусское влияние, характерное для фамилий шляхетского или духовного сословия.

В целом, фамилия Ерцкина — редкая, с чёткой географической привязкой. Её носители, вероятно, происходят из небольшой местности, название которой со временем исчезло из активного употребления. Споров о корне здесь немного: основа ясна, а варианты сводятся к выбору между топонимическим и прозвищным путём, причём первый выглядит убедительнее из-за характерного суффикса.