Фамилия Эшанханова — женская форма фамилии Эшанханов. Это редкая фамилия, которая почти наверняка ведет родословную из Средней Азии, вероятнее всего из Узбекистана или Таджикистана. Основа фамилии — составное имя или прозвище Эшанхан, где первая часть «Эшан» (Ишан) — титул духовного лидера, главы суфийского ордена или почитаемого наставника у мусульман Центральной Азии. Вторая часть «хан» — традиционный тюркский титул правителя или знатного человека.

Таким образом, имя Эшанхан могло означать «хан-ишан» или «ишан, подобный хану». Скорее всего, его давали не при рождении, а как почетное прозвище человеку, который сочетал религиозный авторитет и светскую власть, либо происходил из семьи потомственных ишанов. Фамилии на -ов/-ев в этой среде — явление позднее, возникшее в XX веке при советской паспортизации, когда родовые имена и прозвища закреплялись как официальные фамилии.

Интересная особенность — форма Эшанханова, а не Эшанов или Эшанханов. Суффикс -ов здесь стандартный, но основа не подверглась усечению: к полному двухкорневому имени Эшанхан добавили русский патронимический суффикс. Это говорит о том, что фамилию фиксировали с уже готового составного имени, а не от сокращенного варианта. Встречаются также варианты написания Ишанханов, Эшанханов — с буквой «и» в начале, что связано с особенностями транслитерации с арабской графики или с местными диалектами.

Сословная принадлежность носителей фамилии, скорее всего, была связана с духовенством или с зажиточными слоями, так как титул ишана подразумевал уважение и часто — наследственный статус. Однако в XX веке фамилия могла распространиться и среди людей, не имевших прямого отношения к суфизму, просто как родовое имя. В России и странах бывшего СССР фамилия встречается крайне редко, преимущественно у выходцев из Ферганской долины, Хорезма или Ташкента.