Фамилия Ескуженова — редкий пример, в котором сходятся несколько языковых традиций. Её основа восходит к тюркскому или кавказскому корню, а суффикс -ов-/-ев- указывает на позднюю русификацию, характерную для фамилий, которые оформились в XIX–XX веках в среде горских народов или тюркских этносов, вошедших в состав Российской империи.

Разбираем основу. Скорее всего, в ней лежит личное имя или прозвище Ескужен (вариант Ескужан, Ескюзен). Обращает на себя внимание компонент «еск» — в тюркских языках (кумыкском, ногайском, карачаево-балкарском) это слово означает «старый», «древний», «ветхий». В сочетании с «ужен» или «узен» (в некоторых тюркских диалектах — «река», «русло», «долина») получается прозвище «Старая река» или «Ветхая долина». Однако более вероятно, что «уж» — это усечение от «узак» (долгий) или «узын» (длинный), и тогда Ескужен могло означать «древний долгожитель» или «старый и высокий». В любом случае, прозвище давалось по внешним или возрастным признакам предка.

Суффикс -ен- в основе встречается реже, чем -ан- или -ин-, и может указывать на адаптацию имени через осетинское или адыгское посредничество. Фамилия явно не славянского происхождения, а её носители, судя по географической привязке (фамилия встречается в Кабардино-Балкарии, Карачаево-Черкесии и среди кумыков Дагестана), могли принадлежать к горским обществам, где фамилии закреплялись за целым родом по имени старейшины или по месту жительства.

Поскольку фамилия женская (окончание -а), мужской вариант — Ескуженов. В дореволюционных метриках и списках она могла записываться с буквой «ё» или через «а» (Ескужанова) — путаница типична для устных форм, которые фиксировали писцы на слух. Сословно предки, скорее всего, были узденями (свободными крестьянами) или воинами, так как в горской среде фамилии на -ов редко получали княжеские роды, которые чаще сохраняли исконные окончания без суффиксов.

Точного перевода и единой версии происхождения нет, но наиболее правдоподобной выглядит связь с прозвищем, описывающим долгожителя или человека, живущего у старого русла реки.