Фамилия Евстрахина образована от производной формы крестильного имени Евстрахий — Евстрах. В переводе с греческого это имя означает «пышно колосящийся». Существует и другая версия: имя Евстрах могло возникнуть из другого мужского имени, отличающегося всего одной буквой, — Евстратий. Однако его перевод звучит совершенно иначе: «хороший воин». Один из покровителей этого имени — святой мученик Евстратий, градоначальник, который во время гонений на христиан в III веке объявил себя последователем Христа, за что принял мучения и скончался.

Фамилия образована по стандартной русской модели с суффиксом -ин, который присоединяли к основам, оканчивающимся на -а или -я. В паспортной форме закрепился женский вариант — Евстрахина, хотя мужской вариант — Евстрахин. Такая модель типична для фамилий, возникших в среде простых людей: потомка человека по имени Евстрах называли Евстрахиным, то есть «сыном Евстраха». Скорее всего, основатель рода Евстрахиных был человеком из простого сословия, и фамилия закрепилась в крестьянской или мещанской среде, где отчества и прозвища на -ин были особенно распространены.

Фамилия редкая и географически локализованная. Встречается преимущественно в центральных и южных областях России, что косвенно подтверждает её народное, а не дворянское происхождение. В документах и справочниках фамилия почти не фиксируется, поэтому восстановить точную историю рода сложно — можно лишь опираться на словообразовательный анализ и общий контекст русских фамилий от крестильных имён.

Таким образом, потомок человека, которого звали Евстрах, со временем получил фамилию Евстрахина. В основе лежит либо образ «пышно колосящегося» (от греческого Евстрахий), либо образ «хорошего воина» (от имени Евстратий). Обе версии имеют право на существование, но первая выглядит более прямой, так как форма Евстрах восходит именно к Евстрахию, а не к Евстратию.