Фамилия Эйдинзон — одна из тех, что сразу выдают еврейское происхождение, причём не просто еврейское, а ашкеназское, из Восточной Европы. Её основа — мужское личное имя Эйдл, которое представляет собой ласкательную форму библейского имени Элиэзер. В переводе с иврита Элиэзер означает «Бог мой — помощь». Суффикс -зон (или -сон) в еврейских фамилиях — аналог славянского -ович или немецкого -sohn, то есть «сын». Таким образом, Эйдинзон буквально означает «сын Эйдла». Такая модель образования — имя отца плюс патронимический суффикс — была особенно распространена среди евреев, живших на территории Российской империи, где в XIX веке фамилии присваивались принудительно и часто по отцовскому имени.

Любопытная деталь: написание через «з» (а не через «с», как в фамилии Эйдинсон) указывает на то, что носители фамилии, вероятнее всего, происходят из тех регионов, где в идише и местных говорах звонкий согласный сохранялся — например, из Литвы, Беларуси или северной Украины. В польских или южных украинских землях та же фамилия могла бы писаться как Эйдинсон. Вариант с «з» встречается реже и может служить своеобразным маркером конкретной ветви рода.

Социальная история фамилии типична для еврейских патронимов: её носители в XIX веке были, скорее всего, мещанами или ремесленниками, жившими в местечках черты оседлости. Никакого дворянства или купеческих гильдий за этой фамилией не числится — это фамилия простых людей, получивших её в канцеляриях по месту жительства. Среди известных носителей можно вспомнить разве что советского инженера-конструктора, но это скорее исключение, подтверждающее правило: фамилия не стала громкой, а осталась бытовой, семейной.

Если сравнивать с однокоренными фамилиями — например, Эйдельман, Эйдельштейн или Эйдельсон, — то Эйдинзон стоит особняком. В ней нет суффикса -ман («человек») или -штейн («камень»), которые часто придумывали для красоты. Здесь всё прозрачно и строго: имя предка и указание на родство. Именно это делает фамилию ценной для генеалога — она не скрывает своего происхождения за декоративными элементами.