Фамилия Эйленен — редкий для России случай, когда финское происхождение не вызывает сомнений. Её основа — финское слово «eilen», что значит «вчера». Суффикс «-nen» — один из самых распространённых в финской ономастике, он выполняет роль, близкую к русскому «-ов/-ев» или «-ин», то есть указывает на принадлежность или происхождение. Буквально Эйленен можно перевести как «вчерашний» или «относящийся ко вчерашнему дню».

Такие фамилии — часть большой группы финских «временных» прозвищ, которые могли давать по разным бытовым поводам. В отличие от русских отчеств или прозвищ по профессии, финская модель часто фиксировала случайную, но запомнившуюся черту человека или обстоятельство. «Вчерашний» могло означать, что человек родился накануне какого-то события, опоздал, или его прозвали так за медлительность — «вечно вчерашний». Вторая, менее вероятная гипотеза — связь с диалектным словом «eilas» (вечер), но основной словарь указывает именно на «eilen».

Географически фамилия Эйленен привязана к территориям исторического расселения финнов: Финляндия, Карельский перешеек, Ингерманландия (современная Ленинградская область). В России она встречается в основном среди потомков ингерманландских финнов, которые переселялись или были депортированы в разные регионы. Встречаются варианты написания с удвоенной «н» — Эйленнен, но исходная форма с одной «н» соответствует стандартной финской орфографии.

Сословно фамилия не указывает на дворянство или духовенство — это типичная крестьянская или мещанская фамилия финского происхождения. В метрических книгах лютеранских приходов XIX века такие фамилии фиксировались как наследственные, хотя у финнов долго сохранялась традиция менять фамилию при переезде. Эйленен — один из примеров, где прозвище закрепилось на несколько поколений.