Фамилия Эймулис образована от прозвища Эймул, в основе которого, скорее всего, лежит литовское слово ejimas. На русский язык оно переводится как «ходьба, движение». Вполне вероятно, это прозвище указывало на особенности походки предка (быстрая, легкая). Кроме того, возможно, что такое прозвище получил подвижный, активный человек. Также не исключено, что прозвище Эймул отражало образ жизни родоначальника (часто менял место жительства).