Фамилия Фафыа — редкая, и её происхождение неочевидно. На первый взгляд, она похожа на искусственное образование, но, скорее всего, перед нами результат искажения или упрощения исходной формы. Основа «фаф» не встречается ни в древнерусских именах, ни в распространённых прозвищах. Самая правдоподобная версия — фамилия Фафыа могла возникнуть из крестильного имени. В этом случае исходной формой могло быть имя Фофан (разговорный вариант от Феофан, греч. Theophanes — «богоявление»). При переходе в фамилию звук «ф» мог удвоиться, а окончание измениться под влиянием диалекта или при переписи: Фофанов → Фофа → Фафыа. Вторая версия — фамилия связана с личным именем или прозвищем Фафа, которое в некоторых говорах означало «заика» или «шепелявый» (по звукоподражанию «фа-фа»). Тогда суффикс -ыа указывает на принадлежность: «из рода Фафы» (белорусский или украинский вариант окончания). Третий, менее вероятный вариант — фамилия могла быть записана по ошибке: при замене буквы (например, Пафыа от Пафнутий) или при слиянии двух слов. География фамилии практически не изучена, единичные носители встречаются на юге России и в Беларуси. Точно можно сказать одно: фамилия Фафыа не дворянская и не купеческая — скорее всего, её носили крестьяне или мещане, а современная форма закрепилась случайно, из-за особенностей местного произношения или почерка писаря.