Фамилия Фагерева звучит непривычно для русского уха, и это не случайно. Скорее всего, она имеет нерусское происхождение, а её основа восходит к тюркским или финно-угорским языкам Поволжья. На это указывает характерный суффикс -ев, который в русских фамилиях часто присоединялся к иноязычным основам, адаптируя их.

Самая вероятная версия связывает фамилию с тюркским словом «фагир» или «факир» — так называли странствующего мусульманского аскета, нищего дервиша. В русской среде это слово могло превратиться в прозвище Фагерей для бедного или необычно одетого человека, а затем и в фамилию. Вторая гипотеза отсылает к финно-угорским корням: в марийском языке есть слово «вагыр» (корень, основание), а в удмуртском — «фагыр» (жадный, скупой). Если предок получил прозвище Фагера за скупость или, наоборот, за основательность, то при русификации фамилия могла записаться как Фагерев.

Женская форма Фагерева образована по стандартной русской модели от мужской Фагерев. Поскольку фамилия редкая, её носители, скорее всего, сосредоточены в регионах с историческим влиянием тюркских или финно-угорских народов — в Татарстане, Башкортостане, Удмуртии или на юге Урала. В дореволюционных метрических книгах такая фамилия могла фиксироваться с искажениями: Фагирев, Факарев или Факеев, что затрудняет поиск точной географии.