Фамилия Фалир — редкая и неоднозначная по происхождению. Скорее всего, она имеет искусственное, семинарское происхождение. В духовных училищах и семинариях России XVIII–XIX веков было принято давать будущим священникам «благозвучные» фамилии, часто образованные от латинских или греческих слов. Фалир может быть переделкой латинского phalerae — «фалеры», то есть металлические бляхи или медальоны, которые в Древнем Риме носили как воинские награды. Семинарист мог получить такую фамилию за успехи в учебе или просто как книжную, «учёную» — по аналогии с фамилиями Амплиев, Архангельский или Сперанский.

Вторая версия, менее вероятная, связывает фамилию с греческим словом φαληρός (phalēros) — «белый», «пенистый». Это могло быть прозвище человека со светлыми волосами или с сединой, но для русского быта такое заимствование маловероятно без посредничества церковной среды. В пользу семинарской гипотезы говорит и то, что фамилия не имеет типичных русских суффиксов (-ов, -ин, -ский), а оканчивается на твёрдый согласный. В крестьянской или купеческой среде такие фамилии почти не встречались — их давали либо в училищах, либо выписывали из метрик иностранцам.

Встречаемость фамилии крайне низкая. По открытым данным, Фалиры живут в основном в центральной России и на юге Украины, но численность носителей не превышает нескольких сотен человек. Возможно, фамилия могла возникнуть и как русификация польской или еврейской фамилии (ср. польск. faler — «обманщик», но это уже натяжка). Надёжнее всего принять версию о семинарском корне: Фалир — это фамилия-знак, которую давали не по роду занятий предка, а по книжной моде.