Фамилия Фанинштиль — редкий случай в русском ономастиконе, и её происхождение почти наверняка не славянское, а немецкое или еврейское (ашкеназское). В ней нет привычных русских суффиксов -ов, -ин или -ский, что сразу указывает на иноязычную основу. Скорее всего, это сложное слово, состоящее из двух частей: «Фанин» и «штиль».

Первая часть, «Фанин», может быть вариантом немецкого личного имени Fannin (уменьшительная форма от Johann, то есть Иван), либо фамилией, перешедшей в состав. Вторая часть — «штиль» — это немецкое «Stil» (стиль) или, что вероятнее, диалектное «Still» (тихий, спокойный). В немецких фамилиях часто встречается модель «Имя + характеристика»: например, Фанинштиль могло означать «тихий Фанин» или «Фанин-тихоня». Однако есть и другая версия: «штиль» может быть искажённым «Steil» (крутой, обрывистый) или «Stiel» (рукоятка, стебель), но это менее правдоподобно.

Если фамилия еврейская, то она могла возникнуть в среде ашкеназов, говоривших на идише, где немецкие корни переосмысливались. В таком случае «Фанин» могло восходить к женскому имени Фанни (Фейга, Фаня), а «штиль» — к тому же «Still». Тогда значение прозвища — «спокойная Фанни» или «тихая Фаня». Такие двусоставные фамилии (композиты) были популярны в Австро-Венгрии и Германии в XVIII–XIX веках, когда евреям предписывали брать фамилии. Часто их давали чиновники, комбинируя случайные корни.

Географически фамилия Фанинштиль могла закрепиться в регионах с немецким или еврейским населением: на юге России (Поволжье, Причерноморье), в Прибалтике или в бывших польских губерниях. В дореволюционных метрических книгах она встречается крайне редко, что подтверждает её малочисленность. Носители фамилии, скорее всего, были ремесленниками, мелкими торговцами или арендаторами — люди, чьи предки получили фамилию по указу, а не по наследственному прозвищу.

Словообразовательная модель здесь не славянская, а германская: основа + основа без соединительной гласной, что типично для немецких фамилий-прозвищ (ср. Кляйнштиль, Гроссштиль). В русском языке фамилия не склоняется по падежам в мужском роде (кроме случаев, когда носитель — женщина), что тоже выдает её иностранное происхождение. Если искать аналоги, то ближайшая по структуре фамилия — Фаненштиль (Fahnestiel — «древко знамени»), но Фанинштиль звучит как личное, а не предметное прозвище.

Таким образом, основная версия: фамилия образована от немецкого личного имени (или его варианта) с добавлением характеристики «тихий». Второстепенная версия — от женского имени Фанни в еврейской среде. Однозначно сказать, какая из них верна, без генеалогического исследования семьи нельзя, но первая выглядит надёжнее из-за мужского окончания и типичной для немецкой антропонимики структуры.