Фамилия Файзельханова — редкий пример мусульманской фамилии, образованной на русской почве по стандартной модели с суффиксом -ов/-ев. Основа фамилии — сложное арабско-тюркское имя Файзельхан (или Файзульхан). В нём два компонента: «Файзель» (искажённое «Файзулла» или «Файзал») и «хан». Первая часть восходит к арабскому «файз» — «щедрость», «изобилие», «победа», а в составе теофорного имени Файзулла означает «щедрость Аллаха». Вторая часть, «хан», — тюркский титул, который в составе личных имён часто выступал как пожелание власти, знатности или просто как дань традиции.

Ударение в фамилии, скорее всего, падает на третий слог: Файзельха́нова. Женский вариант фамилии — Файзельханова — указывает на то, что мужская форма (Файзельханов) прошла стандартную для русского языка процедуру адаптации: к основе имени добавился суффикс принадлежности. Такие фамилии закрепились в среде татар, башкир и других тюркских народов Поволжья и Урала в XIX веке, после введения обязательных метрических записей.

Интересно, что в русских документах фамилия могла записываться по-разному: через «а» или «у» в первом слоге (Файзульханов), с буквой «з» или «с» (Файсельханов). Это следствие того, что арабская фонема «за» (звонкий межзубный) на слух русского писаря передавалась то как «з», то как «с». Вариант Файзельханова — скорее всего, татарская огласовка, где гласные смягчились под влиянием местных говоров.

По сословной принадлежности предки носителей этой фамилии — скорее всего, крестьяне или мещане, реже — купцы или духовные лица (муллы). Титул «хан» в составе личного имени не означает прямого родства с ханами: в XIX веке это был распространённый элемент имён, особенно у татар-мишарей и башкир, как знак уважения или пожелание. Фамилия не имеет отношения к дворянству — в России титулованные мусульманские роды (например, князья Юсуповы) носили совсем другие фамилии.

Географически фамилия Файзельханова встречается в Татарстане, Башкортостане, а также в Оренбургской и Челябинской областях — регионах традиционного расселения татар и башкир. Встречаемость низкая, что говорит о происхождении от одного конкретного рода или даже одной семьи, получившей фамилию по имени предка.