Фамилия Файзеханова — редкий случай в русском ономастиконе. Она образована по стандартной русской модели с суффиксом -ов/-ев, но её корни уходят в арабскую и тюркскую культуру. Основа — составное имя Файзехан, где первая часть «Файз» (или «Фаиз») восходит к арабскому «файз» — изобилие, щедрость, милость, а вторая — «хан» — тюркский титул правителя, князя. Таким образом, имя Файзехан можно перевести как «хан щедрости» или «щедрый правитель». Фамилия Файзеханова, соответственно, означает «принадлежащая потомку Файзехана» и в исходной форме (без окончания -а) относится к мужскому роду.

Формант -ов/-ев указывает на то, что фамилия закрепилась в русской среде среди крещёных или интегрированных в русское общество народов Поволжья и Приуралья. Скорее всего, предки носителей фамилии были татарами, башкирами или представителями других тюркских групп, принявшими православие. В среде казанских татар имена с компонентом «хан» были распространены в среде служилых людей и купечества, но Файзехан — имя не самое частое, что делает фамилию достаточно локальной и редкой. Мусульманский корень «Файз» встречается и в других фамилиях (Файзуллин, Файзулин), но сочетание с «ханом» — отличительная черта.

Написание с буквой «е» после «з» (Файзеханова, а не Файзханова) может указывать на особенности произношения в конкретном диалекте или на попытку адаптировать арабский звук под русскую фонетику. Встречается также вариант Фаизханова, но форма с «е» более типична для татарского языка, где гласные в заимствованных словах могли редуцироваться. Географически фамилия тяготеет к Татарстану, Башкортостану и соседним областям, хотя отдельные носители могли появиться в результате миграций в Центральную Россию.

О социальном статусе предков судить сложно из-за редкости фамилии. Имя Файзехан не было простонародным: «хан» в составе имени часто давали в семьях, имевших отношение к военному делу или управлению, пусть и на местном уровне. Однако в русской среде эта фамилия не давала никаких привилегий и фиксировалась как обычная патронимическая, зачастую у крестьян или мещан, принявших православие.