Фамилия Филипченкова — женская форма от Филипченков, а та, в свою очередь, образована от имени Филипп через цепочку уменьшительных форм. В основе лежит крестильное имя Филипп (от греческого «любящий коней»), но до фамилии оно дошло не напрямую, а через обиходный вариант Филипка, Филипко или Филипченок. Суффикс -енк- в данном случае характерен для восточнославянской модели, особенно распространённой на территории современной Украины и в южных областях России. Если бы фамилия формировалась в северных или центральных регионах, скорее всего, возник бы вариант Филипков или Филипкин.

Суффикс -ов в окончании (Филипченков) указывает на принадлежность: буквально «сын Филипченка», то есть внук или потомок человека, которого в быту звали Филипченок. Такая форма — «чьего-то сына» — типична для русских фамилий, которые закрепились в качестве наследственных прозвищ к XVII–XVIII векам. Интересно, что в некоторых говорах «Филипченок» могло быть не просто уменьшительным от имени, а прозвищем по отцу: если главу семьи звали Филипп, его младшего сына или подростка могли называть Филипчонком, а со временем это прозвание перешло на весь род.

Встречаемость фамилии Филипченкова неравномерна. Она заметно чаще попадается в документах из Курской, Белгородской и Воронежской областей, а также в восточных районах Украины. Это косвенно подтверждает версию о южнорусском или малороссийском происхождении, где суффикс -енк(о) был основным способом образования фамилий от имени отца. В переписях XIX века носители такой фамилии числились в основном среди государственных крестьян и однодворцев — особого сословия, жившего на южных рубежах России и нёсшего сторожевую службу.

С точки зрения словообразования, фамилия Филипченкова — пример редкой сохранности трёхступенчатой модели: имя → уменьшительное на -енок → притяжательное на -ов. Многие подобные фамилии со временем упростились (например, Филиппов вместо Филипченков), но здесь устоялся именно развёрнутый вариант. Это позволяет с большой вероятностью утверждать, что предок носительницы фамилии был не просто Филиппом, а именно «Филипченком» — младшим или невысоким человеком, либо тем, кого в семье выделяли по возрасту или положению.