Фаимлия Филипковский образована от производной формы крестильного имени Филипп — Филипка. Имя Филипп в переводе с древнегреческого означает «любитель лошадей». Таким образом, потомок человека, обладающего именем Филипка, со временем получил фамилию Филипковский.