Фамилия Филодельфин — редчайший случай в русском ономастиконе. Она не вписывается в привычные модели, образованные от крестильных имён, прозвищ или профессий. Её основа — греческое словосочетание «филос» (друг) и «адельфос» (брат), то есть «братолюб» или «друг братьев». В русской традиции эта основа чаще встречалась в виде мужского имени Филадельф, которое давали в честь святого мученика Филадельфа, пострадавшего в IV веке. Однако написание фамилии с «о» в первом слоге и с «ин» на конце указывает на иной путь.

Скорее всего, фамилия Филодельфин — это не прямое производное от имени, а искусственное, семинарское образование. В XVIII–XIX веках в духовных училищах и семинариях будущим священникам нередко меняли фамилии на благозвучные греческие или латинские. От исходной фамилии вроде Братолюбов или Братский могли образовать торжественный вариант Филодельфин — по той же модели, что и Афиногенов, Анемподистов или Иеронимов. Суффикс -ин здесь указывает на принадлежность: «сын Филадельфа» или «из рода Филадельфовых», но в реальности это была книжная конструкция, далёкая от бытового прозвища.

Другая версия — фамилия могла возникнуть в среде, связанной с масонскими или философскими кружками, где ценились греческие корни. «Филадельфы» (буквально «братолюбцы») — так называли себя некоторые тайные общества, например, орден «Филадельфов» во Франции XVIII века. Если носитель фамилии был выходцем из дворянской или разночинной среды, увлекавшейся просветительскими идеями, прозвище Филодельфин могло закрепиться как фамильная кличка. Но это гипотеза, документально не подтверждённая.

География фамилии крайне узкая. По данным современных телефонных справочников и баз, Филодельфины встречаются единично в центральной России и на Украине. В дореволюционных метрических книгах эта фамилия почти не фиксируется, что подтверждает её позднее происхождение и малую распространённость. Скорее всего, она принадлежала одному-двум родам, возможно, связанным с духовным сословием.

Сравнение с однокоренными фамилиями — Филадельфов, Филадельфин, Филадельфовский — показывает, что вариант с «о» в корне (Филодельфин) встречается реже, чем с «а» (Филадельфин). Это может быть следствием ошибки в написании при переходе из греческого через латынь или особенностью местного говора. В любом случае, фамилия Филодельфин — яркий пример того, как искусственное, книжное слово стало родовым именем, и её носители могут с уверенностью говорить о связи своих предков с образованной средой, скорее всего, духовной или интеллектуальной.