Фамилия Филющенко — яркий пример украинской модели фамилий на -енко, которые массово формировались в Поднепровье, на Слобожанщине и юге России в XVI–XVIII веках. Суффикс -енко в украинской ономастике означал «маленький» или «сын» (аналог русского -ович), так что Филющенко — это буквально «сын Филюка» или «потомок Филюка».

Основа фамилии — Филюк, уменьшительная форма от крестильного имени Филипп (от греческого «любящий коней»). В украинской народной традиции имя Филипп давало множество производных: Филя, Филька, Филюк, Филюха, Филюша. Суффикс -юк характерен для украинских фамилий запада и центра страны (сравните: Ковалюк, Павлюк, Иванюк), но в сочетании с -енко мы видим гибридную модель: сначала от имени образовали прозвище Филюк, а затем уже от него — патроним Филющенко.

По одной из версий, Филющенко могло возникнуть и без промежуточной ступени Филюк — напрямую от имени Филя с помощью сложного суффикса -ущенко, но это менее вероятно: такие формы встречаются реже и обычно вторичны. Географически фамилия рассредоточена по всей Украине, но чаще встречается в центральных и восточных областях: Полтавская, Черкасская, Харьковская, Днепропетровская. В России Филющенко — редкая фамилия, её носители — потомки переселенцев с Украины времён Российской империи и СССР.

Социальный контекст прост: фамилии на -енко в XVII–XVIII веках носили в основном казаки, крестьяне и мещане. Никакого дворянского или шляхетского оттенка у Филющенко нет — это типичная «народная» фамилия, образованная от обиходного имени. Известных носителей с громкой исторической славой не зафиксировано, что только подтверждает её массовое крестьянско-казачье происхождение.

Если сравнивать с однокоренными фамилиями, то Филющенко стоит в одном ряду с Филюковым, Филюхиным, Филюшкиным — все они восходят к одному имени, но различаются суффиксами, указывающими на регион и эпоху. Филющенко — самый «украинский» вариант, с прозрачной моделью «сын Филюка».