Фамилия Фомушкины образована от уменьшительной народной формы Фомушка крестильного имени Фома. В переводе с арамейского это имя означает «близнец». Именно поэтому библейский апостол Фома, усомнившийся в воскресении Христа, дал жизнь выражению «Фома неверующий», которое стало нарицательным для любого недоверчивого слушателя. Потомок человека по имени Фомушка со временем получал фамилию Фомушкин.

Словообразовательная модель здесь простая и прозрачная: к основе Фомушк- добавили типичный русский суффикс принадлежности -ин, указывающий на родство. Такой тип фамилий, отвечающих на вопрос «чей?», был широко распространен в северных и центральных русских землях. Фамилия Фомушкин встречается в исторических документах. Так, в Книге памяти Калининской области упоминается служащий Моснарпит Фомушкин Николай Яковлевич, родившийся в 1890 году в селе Воскресенье Весьегонского района. Эта запись связывает фамилию с тверской землей, хотя, безусловно, носители могли расселяться и шире.

Стоит отметить, что однокоренные фамилии — Фомин, Фомичев, Фомкин — возникали от разных форм того же имени: полной, отчества с суффиксом -ич или той же уменьшительной, но с другим суффиксом. Фомушкины выделяются на их фоне именно ласкательным, «домашним» звучанием: так в семье могли называть ребенка или взрослого, сохранившего за собой детское прозвище. В старину такие формы не считались фамильярными — они были обычным способом различать людей с одинаковым именем внутри деревни.

О точном месте и времени возникновения фамилии говорить сложно. Процесс формирования русских фамилий растянулся на несколько столетий, и каждая конкретная ветвь могла закрепить прозвание независимо от соседей. Однако сам факт, что фамилия дожила до наших дней и фиксируется в документах XX века, говорит о ее устойчивости. Фомушкины — это не просто наследственное имя, а живая ниточка к далекому предку, которого домашние звали ласково Фомушкой.