Фомушка – уменьшительная народная форма крестильного мужского имени Фома, которое в переводе арамейского означает «близнец». Поэтому выражение «Фома неверующий» стало нарицательным для недоверчивого слушателя. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Фомушка, со временем получил фамилию Фомушкина.