Фамилия Фомякова — женская форма от Фомяков, и её разбор сразу даёт ключ к происхождению. В основе лежит крестильное имя Фома, которое пришло на Русь из древнееврейского и означает «близнец». Но фамилия образована не напрямую от Фомы, а от его производной формы — Фомяка. Суффикс -як в русских именах и прозвищах часто указывал на принадлежность или характерную черту: Фомяк — это «сын Фомы» или «человек, имеющий отношение к Фоме». Такая модель (имя + -як) типична для северных и центральных регионов России, особенно для Вологодчины и Архангельской губернии, где фамилии на -яков встречаются чаще, чем в южных областях.

Притяжательный суффикс -ов в окончании Фомяков закрепил значение «чей?» — то есть потомок Фомяка. Интересно, что форма Фомяк могла быть не только уменьшительной, но и прозвищной: в некоторых говорах «фомякой» называли нерасторопного или простоватого человека, но это скорее народная этимология, не подтверждённая строгими источниками. Основная версия, которую поддерживает и словарь русских фамилий Б. Унбегауна, — образование от канонического имени через обиходную форму.

С точки зрения социального состава, фамилия Фомяков не была дворянской или купеческой — она типична для крестьянской и мещанской среды. В переписных книгах XVII–XVIII веков такие фамилии фиксировались у землепашцев и ремесленников, особенно в северных уездах. Если ваши предки носили эту фамилию, скорее всего, они жили вдали от столиц, в лесной или приозёрной местности, где имя Фома было распространено не меньше, чем Иван или Пётр.

Редкость фамилии Фомякова (по сравнению с массовыми Фомин, Фомичёв) объясняется тем, что суффикс -як в фамилиях — локальная, а не общерусская черта. Встречаются однокоренные варианты: Фомягин, Фомякин, но Фомяков — один из наиболее устойчивых. В современной России фамилия сохранилась в основном в Вологодской и Кировской областях, а также среди потомков переселенцев в Сибири.